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PCだけでできるインシリコ創薬論文紹介1
機械学習で、薬候補を先にふるいにかける創薬研究
論文例pubs.rsc.org/en/content/arti…
link.springer.com/article/10…
nature.com/articles/s41598-0…
🤖 Made with AI
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一緒にインシリコ創薬を広める活動をしているchiral @chiralscienceが、SusHi Techのピッチコンテストのセミファイナリストに選ばれました!
4/27にセミファイナルのコンテストが東京ビックサイトであるようなので、ご興味ある方はぜひ足を運んでみてください!
sushitech-startup.metro.toky……
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📢In silico創薬コミュニティの第一回分子ドッキングコンペの最終結果発表をしました!
沢山のご参加、ご応募誠にありがとうございました!
入賞者の皆さま、おめでとうございます🎉🎉
今後ランキングの上位手法の解説記事を作成予定です。
コンペ終わった後でも勉強になりますので、興味ある方はぜひお入りください!
Chiral(@chiralscience)協賛のもと、In silico創薬コミュティを作りました!
・初心者歓迎
・定期的にコンペを開催
・アウトプット支援(論文化、副業案件紹介など)
を積極的にしていき、実力、キャリアを積極的に支援します。
登録はこちらから。
(応募後、Discordリンクが表示されるので、そちらからお入りください!)
forms.gle/jZvh88CiHitNTSV69
In silico創薬を楽しみましょう!
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ずっとやっていたペプチドの低分子化のワークフローを開発しました!
低分子化したのは良いがどう合成するか難しいところですが、その逆合成解析も自動でアウトプットするようにしました!
ペプチド医薬品の「膜透過性」や「代謝安定性」の課題を、AIの力で突破する🚀
ペプチド-タンパク質複合体のPDBファイル1つから、活性を維持した低分子(ペプチドミメティクス)を自動設計するパイプラインの開発手法を公開しました!
創薬研究のスピードを次のフェーズへ
labo-code.com/bioinformatics…
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朝起きたら、参加者同士のディスカッション盛り上がっていて感激しました!🥰
気軽に投稿していただいて、みんなで知識をアップデートしていきましょう!!!
私も知ってる範囲でコメントいたします!
質問が宙を漂うという寂しいことは絶対にしません!
Chiral(@chiralscience)協賛のもと、In silico創薬コミュティを作りました!
・初心者歓迎
・定期的にコンペを開催
・アウトプット支援(論文化、副業案件紹介など)
を積極的にしていき、実力、キャリアを積極的に支援します。
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In silico創薬を楽しみましょう!
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コミュニティ限定動画として、DrugFlowの解説動画を作成しましました!最終インプットとして、マクロサイクリックな分子が生成されたのは驚きでした。
ぜひご覧ください!
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・初心者歓迎
・定期的にコンペを開催
・アウトプット支援(論文化、副業案件紹介など)
を積極的にしていき、実力、キャリアを積極的に支援します。
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In silico創薬を楽しみましょう!
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環状ペプチドのMD simulationの記事も書きました。
これで環状ペプチドデザイン→スクリーニング→MDまでの記事が揃いました!
In silicoペプチド創薬の教科書
zenn.dev/labcode/books/6c6dc…
にMDの記事を追記し、今週の土曜に値上げしますので、興味ある方はお早めに。
【新着記事】
In silicoペプチド創薬の要、GROMACSでのMDシミュレーション手順を徹底解説!
ColabFold等で予測した複合体構造の「欠損原子の修復」から「本番MD実行」まで、コピペで動かせる具体的なコマンド付きで公開しました!
詳細はこちら👇
labo-code.com/bioinformatics…
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開催しました!🎉🎊🎉
標的はガン標的タンパク質ABL1(PDB ID:2GQG)です!
歴史の深い標的に対して、インシリコ創薬をしていき、一緒に学んでいきましょう!
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・アウトプット支援(論文化、副業案件紹介など)
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In silico創薬を楽しみましょう!
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現在最終調整中ですが、まもなく第一回分子ドッキングコンペ開始予定です。
高校生から社会人50代まで幅広い層の50名ほどの方が参加してくださっています!
半数以上くらいがインシリコ創薬初心者なので、少しでも興味ある方いましたらぜひ!
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・初心者歓迎
・定期的にコンペを開催
・アウトプット支援(論文化、副業案件紹介など)
を積極的にしていき、実力、キャリアを積極的に支援します。
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In silico創薬を楽しみましょう!
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【標的タンパク質募集】
現在様々な観点から今回の低分子ドッキングコンペの標的タンパク質を探しております。
もしユニークで面白いタンパク質、思い入れのあるタンパク質がありましたら、ぜひDMやスレッドで返信いただけると大変ありがたいです!
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・初心者歓迎
・定期的にコンペを開催
・アウトプット支援(論文化、副業案件紹介など)
を積極的にしていき、実力、キャリアを積極的に支援します。
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In silico創薬を楽しみましょう!
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昨日のツイートから既に13人のコミュニティ参加がありました!
卒研、修論、博論終わって時間が少し空いている方、はたまた学部生も歓迎です!
初心者が入りやすいようにチュートリアル動画も作成中ですので、迷っている方いればぜひ参加してみてください!
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・アウトプット支援(論文化、副業案件紹介など)
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In silico創薬を楽しみましょう!
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Thrilled to announce Boltz-1, the first open-source and commercially available model to achieve AlphaFold3-level accuracy on biomolecular structure prediction! An exciting collaboration with @jeremyWohlwend, @pas_saro and an amazing team at MIT and Genesis Therapeutics. A thread!
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【完全版】In silico創薬実践書 〜おうち創薬で論文を書こう〜
zenn.dev/labcode/books/1e05d…
が気づいたらZennでの売り上げが100冊いきました!
結構大変だったReviseの実験も今年中には追加したいと思います!













