"Le vivant malgré sa grandeur parle un tout petit alphabet" Changement d'ambiance à nouveau pour l'après midi, je compte des k-mers ... (Regarder défiler les chiffres et les lettres, c'est en quelque sorte une variante des vaches qui regardent passer les trains.)

Après avoir répondu à une bonne quantité de mails (je vous épargne une photo illustrative), je me suis rendu dans un de nos laboratoires L2 qui héberge deux séquenceurs très différents et très complémentaires, le MiniSeq d'Illumina et le GridION d'Oxford Nanopore.

Voici les résultats obtenue lors d’une précédente expérience. Sans rentrer dans les détails, le pool de bactéries (donneuse et notre souche d’intérêt) est isolé sur une milieu avec deux antibiotiques permettant de sélectionner seulement notre souche d’intérêt ayant un transposon.